[imyota]

事实上MATLAB中的中值滤波若直接用medfilt2函数。默认的就是3x3的窗口，如果用5x5，可直接设定参数例如：
I=imread('9.bmp');
A=rgb2gray(I);
IMG_MED=medfilt2(A,[5 5]);
figure,imshow(IMG_MED);
是可以的，但是你的滤波效果和窗口的大小有关，具体问题具体分析。
另外建议楼主，如果是中值滤波的话，最好还是自己写程序，其实不难。